过去在元世祖忽必烈时期，就设立有国史院，曾经任命王鹗编纂辽、金两个朝代的史书，到宋朝灭亡以后，又任命史学大臣编写三个朝代的历史。到了元仁宗爱育黎拔力八达、元文宗图帖睦尔时期。又颁布诏令，编写三代历史，但是由于元朝长期动荡不安，到那时也没有完成编纂史书的工程。
脱脱接受任命后。向部下官员们下令，竭尽全力，广泛征集各三个朝代留下来的史书文献，认真阅读，深入讨论。夜以继日，不得停息。因此欧阳玄擅长文艺，文章写得特棒，史书中的所有序言和条例，评论。表彰，报告之类的文章，都全部由他起草，后来略加修正，最先编写完成了辽史，后来又编写完全了金史，宋史，史书编写完成后，受到了国内外的广泛好评。脱脱又向朝廷提出请求，对史书进行再次修订，向全国颁发，元顺帝妥欢帖睦尔批准了他的请求。
元顺帝妥欢帖睦尔有一次视察宣文阁，了解史书的编写情况，脱脱见机行事，向皇帝报告说：“陛下你临御执政以来，天下平安无事，应该抓住时机，专注圣人的学问。我近来听说你左右有人在暗中百般阻拦，难道那些经典史书都不值得阅读吗？如果毫无价值，过去在元世祖忽必烈在世的时候，何必要反复教导裕皇真金，多读经典史书呢！”元顺帝妥欢帖睦尔听了，不停地点头，连声称赞，脱脱说得很对。
脱脱为了让皇帝好好阅读，立即行动，在秘书监的图书室中，取出元裕宗真金所接受的书籍，送进皇帝居住的进皇宫大内，又举荐学识渊博，没有在朝廷做官的处士完者图、执理哈琅、杜本、董立、李孝光、张枢等人，让他们接受皇帝诏令。完者图、执理哈琅、董立、李孝光等人，就应征到了京城，朝廷下令，任命完者图、执理哈琅为翰林待制官，负责编写史书，李孝光为著作郎。只有杜本隐居住在清江，张枢隐居在金华，坚决推辞，没有到京城接受任命。他们都是当时的著名学者。元顺帝妥欢帖睦尔听说他们二人，不肯接受朝廷的征召，感到成分惋惜，不停地叹息。
朝廷更换了许多官员，罢免了左丞相帖木儿不花，改由别儿怯不花继任他的职务，别儿怯不花与脱脱，他们之间有过节，关系很不协调，经常发生矛盾，相持了一年多的时间，那时脱脱已经年老，体弱多病，提出报告，向朝廷辞职。元顺帝妥欢帖睦尔没有批准他的请求，脱脱为了达到辞职的目的，接连提出了十七次报告，元顺帝妥欢帖睦尔为此召见了脱脱，问他谁可以代替他的职务。脱脱回答说，阿鲁图可以继任。
阿鲁图是元世祖忽必烈时期的功臣，博尔术的第四代子孙，曾经任知枢密院事官，世袭爵位为广平王，因此获得脱脱的推荐，朝廷就下令，让他继任右丞相。朝廷另外封脱脱为郑王，把安丰作为他的领地，朝廷还赏赐给他成千上万的黄金白银，脱脱都百般推辞，没有接受。阿鲁图就职后，元顺帝妥欢帖睦尔任命他为国史总编，阿鲁图以没有阅读过史书为借口，想推辞这个职务，但是元顺帝妥欢帖睦尔没有批准他请求。幸好脱脱虽然辞去了丞相的职位，却仍然参与国史的编写事务，因此辽、金、宋三朝历史，才最终得以完成。
元朝至正五年，阿鲁图等人把编写完成的三部史书，送皇宫，请元顺帝妥欢帖睦尔审阅，元顺帝妥欢帖睦尔对他说：“历史既然已经编写成书，关系重大，前代君主的善事和恶行，都应该全部予以记录。那些行善的君主，朕我应当他们学习，那些作恶的君主，朕我应当引以为戒，这是朕我应该做的事情。但是史书也不仅是为了劝告人间的君王，史书也记录了许多朝廷大臣，卿你等人也应该改恶从善，向古代圣贤学习。只要朕我做得不对之处，卿你等人也不妨向我直言，不得隐瞒！”元顺帝妥欢帖睦尔这一席话说得真好，虽然历代的圣贤君王。也没有人能超过他，但是以后的事实证明，他的所作所为。都是有始无终，真让人无何奈。他真是一位言行不一的君王！阿鲁图等人，听了他的话，无比佩服，跪拜地上，不停地对皇帝连声称赞，向皇帝告辞，退出了皇宫。
当时翰林学士承旨巙巙在京城中去世。元顺帝妥欢帖睦尔听到讣告后，叹息不已，深切哀悼。他对巙巙极为了解，他不禁回忆起与巙巙的多年交往。回忆巙巙的许多往事。巙巙年幼时就进入中央政府开办的国学，他在那里勤奋学习，博览群书，曾经拜当时的著名学者许衡为师，懂得了修身养性的道理。在元顺帝妥欢帖睦尔初年。曾经被任命为经筵官，劝告元顺帝妥欢帖睦尔研究学问，增长才能。元顺帝妥欢帖睦尔很想拜巙巙为师，向他求教学问，但是巙巙极为谦虚。百般推辞，没有接受。
有一天，巙巙站在皇帝的身边，与皇帝探讨学问，元顺帝妥欢帖睦尔提出想观赏皇宫收藏的历代名画，巙巙就有意取也比干剖心的图画，让皇帝观赏，他对皇帝说商王纣就是因为不听从忠臣的劝告，最后才导致了亡国的结局。元顺帝妥欢帖睦尔听了，若有所思，很受启发。又有一天，元顺帝妥欢帖睦尔以观赏宋徽宗绘画的时候，一再称赞宋徽宗的绘画极为精妙，巙巙见机行事，对他提出劝告说：“宋徽宗的确是多才多艺的人才，只是有一件事却毫无才能。”元顺帝妥欢帖睦尔对此疑惑不解，问他是什么事无能，巙巙回答他说：“只是不能当好人间的君王！陛下你试想，宋徽宗当年，自身被敌军俘虏，国家几乎灭亡，如果他能尽到君王的道义，怎么弄到那种结局呢？由此可见，身居九五之尊，作为一国的君王，第一件最重要的事就是当好君王，除此之外，其他也不必过去上心，不能因小失大，本末倒置。”巙巙真是很有政治智慧的人，他见机行事，趁热打铁，在适当的场合，不停地向皇帝提出适当的劝告，真是很有智慧，善于运用劝告艺术。但是后来的事实证明，元顺帝妥欢帖睦尔还是重犯忌古人的错误，重蹈古人的覆辙，真让巙巙无可奈何。元顺帝妥欢帖睦尔当时听了，也若有所悟，惊恐地回答说：“卿你这样诚恳地劝告我，真是很识大体，为天下百姓作想。”但是元顺帝妥欢帖睦尔后来却把这些话忘记得一干二净，没有治理好国家，元朝也在他的手里灭亡。